Organisation des partitions

Depuis le 25 juillet 2022, une nouvelle organisation des partitions a intervenu dans EXPLOR. La nouvelle organisation est représentée ci-dessous:

Screenshot1

Attention

L’allocation générale dans la partition inclut désormais les nœuds de l’ancienne partition freeXXX. Si vous ne sélectionnez aucun nœud spécial, il est possible que votre JOB soit terminé en raison de la priorité des JOBS dans les nœuds MyXXX. Pour éviter cette situation, envisagez de sélectionner les nœuds appropriés en excluant les nœuds privés. Pour savoir comment procéder, veuillez vérifier les informations dans l’élément (4.3 et 5).


Tableau des associations

Avant
25 juillet 2022		 Après
25 juillet 2022		 Hostname # noeuds #CPU FEATURE
std std cna[01-64] 64 32

BROADWELL,OPA,INTEL
std std cnb[01-64] 64 32

BROADWELL,OPA,INTEL
sky std cnc[01-64] 64 32

SKYLAKE,OPA,INTEL
ivy std cnd[01-12] 12 16

IVY,IB,INTEL
hf std cne[01-16] 16 8

BROADWELL,INTEL,HF
freehf std cnf[01-08] 8 8

SKYLAKE,OPA,INTEL,HF
freecas std cng[01-12] 12 40

CASCADELAKE,OPA,INTEL
freelhf std cnh[01-02] 2 8

CASCADELAKE,OPA,INTEL,HF
freestdcas std cni[01-24] 24 40

CASCADELAKE,IB,INTEL
freestdepyc std cnj[01-64] 64 48

EPYC3,IB,AMD
freehfcas std cnk[01-08] 8 8

CASCADELAKE,IB,INTEL,HF
-- std cnl[01-18] 18 32

EPYC4,IB,AMD
p100 gpu gpb[01-06] 6 32

BROADWELL,OPA,P1000,INTEL
gtx gpu gpc[01-04] 4 32

BROADWELL,OPA,GTX1080TI,INTEL
freet4 gpu gpd[01-03] 3 24

CASCADELAKE,OPA,T4,INTEL
freertx6000std gpu gpe[01-02] 2 40

CASCADELAKE,IB,RTX6000,INTEL
-- gpu gpf[01] 1 32

CASCADELAKE,L40,INTEL
myXXX myXXX --- -- -- ---------

Note

Les partitions mystdcasXXX seront désormais accessibles par une seule partition mystdcas
(mystdcaslemta, mystdcasijl, mystdcascrm2) ==> mystdcas


Les instructions de soumission

(1) Toutes les soumissions doivent contenir toujours

#SBATCH --account=MY_GROUP

ou

#SBATCH -A MY_GROUP


(1.1) Information spéciale – Soumission MyXXX avec une association de projet différente

Pour utiliser une association de projet différente pour ceux qui ont de nombreux projets, veuillez supprimer de votre script l’option #SBATCH -A/--account et ajouter à l’extérieur avec la ligne de commande.

%sbatch --account MY_GROUP my_subm_scrit.slurm

ou

%sbatch -A MY_GROUP my_subm_scrit.slurm

MY_GROUP: devrait être votre identifiant de projet, vous pouvez le vérifier dans l’invite de votre terminal

[<utilisateur>@vm-<MY_GROUP> ~]


(2) En général, les cas où vous n’êtes pas obligé d’avoir une machine spéciale

Attention

L’allocation générale dans la partition inclut désormais les nœuds de l’ancienne partition freeXXX. Si vous ne sélectionnez aucun nœud spécial, il est possible que votre JOB soit terminé en raison de la priorité des JOBS dans les nœuds MyXXX. Pour éviter cette situation, envisagez de sélectionner les nœuds appropriés en excluant les nœuds privés. Pour savoir comment procéder, veuillez vérifier les informations dans l’élément (4).

Important

Les partitions privés MyXXX non preemptables sont: mystdepyc (cnj[01-64]) et mygeo(cnl[05-18]).

(2.1) tout type des machines dans std

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=std

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=4

ou

#SBATCH -A MY_GROUP

#SBATCH -p std

#SBATCH -J Test

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 4


(2.2) tout type des machines dans gpu

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=gpu

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=1

#SBATCH --gres=gpu:2

ou

#SBATCH -A MY_GROUP

#SBATCH -p gpu

#SBATCH -J Test

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 1

#SBATCH --gres=gpu:2


(3) Matériel Hébergé – continue comme avant

Les partitions mystdcasXXX seront désormais accessibles par une seule partition mystdcas

(mystdcaslemta, mystdcasijl, mystdcascrm2) ==> mystdcas

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=mycas

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=4

ou

#SBATCH -A MY_GROUP

#SBATCH -p mycas

#SBATCH -J Test

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 4


(4) Sélection précise des nœuds

La sélection des nœuds spécifiques se fait à travers les caractéristiques (FEATURES) présentées dans le tableau d’association ci-dessus. Voir les exemples ci-dessous:

#SBATCH --constraint=SOMETHING_FROM_FEATURES


(4.1) Sélection de nœuds de l’ancienne partition sky

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=std

#SBATCH --constraint=SKYLAKE,OPA,INTEL

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=4

ou

#SBATCH -A MY_GROUP

#SBATCH -p std

#SBATCH -C SKYLAKE,OPA,INTEL

#SBATCH -J Test

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 4


Screenshot3

(4.2) Sélection de nœuds de l’ancienne partition 

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=gpu

#SBATCH --constraint=BROADWELL,OPA,P100,INTEL

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=1

#SBATCH --gres=gpu:2

ou

#SBATCH -A MY_GROUP

#SBATCH -p gpu

#SBATCH -C BROADWELL,OPA,P100,INTEL

#SBATCH -J Test

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 1

#SBATCH --gres=gpu:2


Screenshot4

(4.3) Suppression de tous les nœuds de l’ancien freeXXX/MyXXX machines et en sélectionnant tous les autres anciens nœuds (std, sky, ivy, hf)

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=std

#SBATCH --constraint=NOPREEMPT

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=4

ou

#SBATCH -A MY_GROUP

#SBATCH -p std

#SBATCH -C NOPREEMPT

#SBATCH -J Test

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 4

Screenshot5

(5) Restart/Requeue preempted JOBS

Ce n’est pas une fonctionnalité pour les JOBS qui se terminent par une erreur. Il s’agit d’une fonctionnalité pour les JOBS qui peut avoir été supprimée de l’exécution par la règle . Si vous souhaitez soumettre à toutes les machines de la partition STD, même si sur certaines machines votre JOB peut être supprimé pour donner la préférence à un autre avec une priorité plus élevée, il est possible d’utiliser la fonctionnalité de remise du JOB dans la file d’attente (--requeue)

#SBATCH --account=MY_GROUP

#SBATCH --partition=std

#SBATCH --requeue

#SBATCH --job-name=Test

#SBATCH --nodes=1

#SBATCH --ntasks=4